准确的产前诊断对于预防出生异常的重要性怎么强调也不为过。传统的核型分析(一种检查细胞样本中染色体的测试)可以追溯到 20 世纪 60 年代末，并且已经很成熟，但技术的进步提供了新的选择。

华大基因研发部孙燕博士、宋丽杰博士、郭学勤博士领导的一项新研究发表在《Journal of Medical Genetics》上，旨在验证低通基因组测序 (LP GS) 作为染色体微阵列分析的替代方法(CMA)产前诊断。此外，还探讨了LP GS中测序深度的关键因素，这也是以往研究的空白。

该研究分析了 375 份羊水样本，并将 LP GS 与 CMA 的诊断性能进行了比较。令人惊讶的是，两种方法的诊断率相同，均为 8.3%。在 CMA 结果为阴性的情况下，LP GS 的表现优于其他 6 个意义不确定的拷贝数变异(CNV——导致一个或多个基因拷贝数异常的基因组改变)。

这一结果强调了 LP GS 在检测遗传异常方面的稳健性，而 CMA 可能会漏掉这些异常。

研究发现，CNV 的大小显着影响低通基因组测序检测的灵敏度。小型 CNV 和位于特定区域的 CNV，例如 Y 染色体的无因子 c (AZFc) 区域，对测序深度的变化更敏感。相比之下，较大的 CNV 受测序深度的影响较小。

该研究建议将 2500 万个独特比对的高质量读数 (UAHR) 的测序深度作为检测大多数非整倍体和微缺失/微重复的最佳选择。这种测序深度在检测灵敏度、成本效益和解释工作量之间取得了平衡。

这些发现增加了关于 LP GS 作为真实临床环境中的一级产前诊断方法的重要验证和数据，强调了其测序深度在 LP GS 中的关键作用，并确立了 2500 万个 UAHR 阈值。