研究人员发现了一种新方法来筛选导致几种不同类型癌症生长的基因，从而确定了口腔癌和食管鳞癌精准肿瘤学特别有希望的靶标。

这项研究发表在本月的《细胞报告》杂志上，使用称为类器官的器官组织的 3 维模型来识别和测试癌症基因组图谱中的潜在基因靶标。

“癌症基因组图谱中有大量数据，该领域已经开发出延长生命和挽救生命的精准药物。但这些数据中只有一小部分告诉我们癌症如何生长以及它是否是药物靶点，”主要作者博士解释道Ameen Salahudeen是诺伊大学芝加哥分校医学和生物化学助理教授，研究开始时曾是斯坦福大学Calvin Kuo实验室的博士后研究员。“我们需要一种可扩展的、功能性的方法来从驱动癌症生长的因素以及是否可以作为目标方面对数据进行全面了解。”

为了查明导致肿瘤生长的基因，研究人员决定将重点放在基因组中表现出两种情况的区域：具有异常高拷贝的同一基因的区域，这是许多类型癌症所共有的，以及具有高水平拷贝的区域。 RNA 表达的变化，这表明这些基因与肿瘤生长有关。为此，他们使用了由当时在克里斯蒂娜·柯蒂斯实验室工作的 Jose Seoane 博士在斯坦福大学开发的一种新颖算法。

研究小组在基因组中确定了六种不同癌症的有希望的区域：食道癌、口腔癌、结肠癌、胃癌、胰腺癌和肺癌。接下来，他们为六个器官中的每一个构建了肿瘤类器官(培养皿中的小肿瘤组织)，并在类器官上测试了它们的候选基因，看看哪些基因与肿瘤生长相关。