一篇题为“通过氧化应激特征对膀胱尿路上皮癌进行预后模型开发和分子亚型识别”的新研究论文已发表在《Aging》杂志上。

越来越多的研究表明，氧化应激(OS)显着促进肿瘤进展。在这项新研究中，研究人员重点关注膀胱尿路上皮癌(BLCA)，这是一种全球范围内正在迅速增长的恶性肿瘤。

研究人员解释说：“我们的目标是通过构建预测膀胱癌结果的模型来验证与总生存期 (OS) 相关的基因的预测精度，并评估这些遗传标记的预后重要性。”

转录组数据从 TCGA-BLCA 和 GSE31684 获得，它们分别是癌症基因组图谱 (TCGA) 和基因表达综合 (GEO) 的组成部分。为了描绘不同的分子亚型，研究人员采用了非负矩阵分解(NMF)方法。使用套索回归、多变量 Cox 分析和单变量 Cox 回归分析评估 OS 相关基因在预测结果中的重要性。对于外部验证，他们使用了 GSE31684 数据集。CIBERSORT用于检查肿瘤免疫微环境(TIME)。

使用基于风险特征的校准和受试者工作特征 (ROC) 曲线创建并验证列线图。研究小组检查了高风险和低风险组之间临床特征和肿瘤突变负荷(TMB)的差异。为了评估免疫疗法的潜力，根据风险评分计算免疫现象评分(IPS)。最后，采用pRRophetic算法来预测化疗药物的IC50值。