新颖的工作流程缩小了检测 5q-脊髓性肌萎缩症的差距

5q-脊髓性肌萎缩症 (5q-SMA) 是脊髓性肌萎缩症 (SMA) 中最常见的类型之一，全世界约有万分之一的患者受到影响。目前，测试无法检测导致 5q-SMA 的所有致病基因变异。然而，研究人员通过使用修改后的分析工作流程，能够在诊断性全外显子组分析中可靠地识别出患有 5q-SMA 的患者，其中包括几名没有表现出典型症状的患者。他们在《神经肌肉疾病杂志》上报告了他们的结果。

“最新的治疗方法表明，早期干预可以显着改善临床结果，因此早期诊断 5q-SMA 非常重要，”慕尼黑大学 Friedrich-Baur 研究所医学遗传学中心和神经病学系首席研究员 Angela Abicht 医学博士解释道慕尼黑诊所。

在 96% 的病例中，5q-SMA 是由 SMN1 基因纯合性缺失(两个等位基因均丢失)引起的。然而，大约 4% 的患者仅携带 SMN1 缺失和另一个等位基因上的单核苷酸变异 (SNV)。

通常用于全外显子组测序的短读长下一代测序 (s-rNGS) 通常无法检测具有 5q-SMA 的个体。根本原因是导致这种情况的基因 SMN1 拥有一个几乎相同但无功能的副本，称为 SMN2。因此，典型的生物信息学算法在尝试将读取序列准确分配给任一基因时遇到困难。明确的读取被随机映射到一个区域，然后分配低映射质量，这导致它们被变异调用者排除。因此，通过标准生物信息学流程鉴定删除或改变的 SMN1 基因是不可能的。

研究人员回顾性分析了两组在 2021 年 11 月至 2022 年 11 月期间接受基于 s-rNGS 的诊断性外显子组分析的患者。第 1 组由 1,684 名具有神经肌肉表型的患者组成，证据表明至少存在以下一项：人类表型本体(HPO)表型或其直接后代：肌肉异常或周围神经病变。第 2 组由 260 名患者的胎儿样本组成，这些患者在一年内接受了外显子组测序，作为产前诊断的一部分。

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